סיכון בפרשנות הנתוניםהיתרונות הנראים לעין ממינון חוזר עשויים להיות מושפעים מהטיה בבחירת הנבדקים, דבר שמסבך את פרשנות התוצאות בשלבי הביניים ומחליש את מידת האמון באיתותי היעילות.
מימון וסיכון מסלול מזומניםדווח על משאבי מזומן מוגבלים ביחס לצורכי ניסוי ציר מרכזי גדול, מה שהופך מימון נוסף או שותפות אסטרטגית לסבירים, דבר העלול לדלל את בעלי המניות או לעכב תוכניות.
חוסר ודאות בעיצוב הניסוי כתוצאה משונות במינוניםהשונות במינונים במהלך ניסויים קודמים מחלישה את חוזק אותות ההישרדות ויוצרת חוסר ודאות לגבי העיצוב האופטימלי ונקודות הסיום לניסוי רחב היקף יותר.